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第15章 手到擒来（第2页）
对于每一个评估窗口的短序列，我们利用现成数据库中的544个描述氨基酸的物理化学性质的指标来表示氨基酸，因此，每一个位点的氨基酸就会是一个544x1的矩阵，十三个这样的矩阵合并用以表示一个长度为13的肽段序列。对于一个评估窗口的544x13矩阵，我对k-means++算法进行了优化，然后用优化后的算法进行聚类，将544个行向量聚类为5o类，在可视化方面，每一类则代表一个波形，对于每一类，我们可以利用该类所包含矩阵子集的每一列算术平均值来产生该类的标志性波形。”
陈元光把打印好的论文递给莱维特之后，简单介绍了一下他的思路。
莱维特的重要工作方向中就包含蛋白质模拟，通过计算分析蛋白质序列去预测蛋白质结构，专注于同源建模。
陈元光写的论文和他的方向高度一致，而且体现的思想和算法的优化都有非常高的价值。
刚开始莱维特还有些不以为然，因为他知道对方还是大四学生，他觉得对方拿出来的论文不过是为了找话题写的论文，充其量是篇概括的不错的综述。
结果没想到一上来就放大招，无论是设计的计算规则，还是说对经典聚类算法k-means++的优化，都充满了思考。
“很棒的工作。”莱维特点评了一句后，和陈元光围绕论文中的一些细节问题进行讨论。
而郭伟则陷入了怀疑人生的状态，我是谁，我在哪？
郭伟是13年加入鹅厂的，5年时间做到了鹅厂视频的高级经理，也是名校毕业出身，因为做版权运营经常需要出国的缘故，英语没有落下，不是那种四六级考试通过的理论派，说的不好，但是也是能用英语直接对话的。
他就只见陈元光和莱维特之间nicetomeetyou完，陈元光递了一沓纸给莱维特，然后双方的聊天内容他就完全听不懂了，大量专业词汇，他连蒙带猜都听不懂什么意思。
郭伟心想，现在的年轻人都已经这么猛了吗？
“没错没错，是这样的，有保留区域来避免dhR8的内部螺旋氢键相互作用的点位被破坏，避免破坏重复蛋白结构基序，这种设计是对的，这样的模拟既能模拟真实情况，又能把突变限制在一定范围。”
“很棒的点子，不断随机模拟，然后挑选出差异度最小的作为最佳匹配，然后和波形比对计算出拟合优度。”
莱维特对陈元光的论文大加赞赏，本来莱维特给这场对话的预留时间是十五分钟，现在聊了两个多小时，他还有点恋恋不舍。
“元光，你的论文只差一个东西，那就是实验去验证你的理论，利用你模拟的办法把dRh8改造成可以结合核酸的短肽。
有那个这篇论文可以nature，没有那个也能，不过可能只能子刊。”莱维特说道。
陈元光回答道：“我有思路，后面我去找学校申请，把它完善一下。”
因为之前没有实验室给他用，所以陈元光的这篇论文完全是计算模拟，差实验检验的部分。
莱维特问：“这篇论文是你一个人独立完成还是和其他人共同完成？”
光是刚刚双方的沟通，莱维特知道这篇论文的主要贡献者肯定是陈元光，因为里面的思路和设计，他说的非常清楚。
陈元光说：“我一个人。”
莱维特说：“那到时候nature的时候，如果你不介意可以给我挂个第二作者，这样它就肯定能表在nature上了。”
（本章完）
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四皇红发的女儿认我当爹很合理吧
本书简介避雷点总结在第一章有话说，或者直接看文案最下方本文将于2023319日入v，感谢大家支持正版文案在被红发抛弃在音乐之岛的一年后，uta在海边捡到一个溺水者。溺水者20岁的年纪，身上穿的衣服像是几十年前的版型，搜出来的贝利硬币也是她从未见过的样式。照顾她的先生在见到男人长相后找出一张早已泛黄破损的悬赏令。黑炎格雷，恶魔果实能力者，四十年前当之无愧的海上霸主。可惜还未等到和海贼王交手，便失踪在如今被称为新世界的这片海域中。 黑炎格雷，黑炎果实能力者，黑炎海贼团船长，也是知晓剧情的带系统穿越者。别人穿越剧情开始，直接和主角对线。他穿越，穿越到主线开始的五十多年前，跟谁对线？连海贼王都还是无名小卒的时候。但总归是穿越了嘛。本着来都来了的想法，他开始变强买船招揽船员，去找现在还年轻的原著老一辈刷好感度。好感度刷完了，他在系统帮助下秘密找到天月时，让对方‘啪’的一下把自己送到未来。格雷啊主线，我来了！于是，在黑炎格雷神秘失踪的四十年后，一张从东海秘密传来的悬赏令震惊了海军高层和新世界。海军四巨头回忆起那位骗吃骗喝骗感情，最后拍拍屁股跑去当了海贼的前海军天才。某老爹某大妈某海贼王副船长想起骗吃骗喝骗感情，最后拍拍屁股连人带船带船员一起消失无踪的某人形天灾。某相对年龄尚小的红发啊，罗杰船长喝醉酒的时候和我们提起过，黑炎格雷，但这些完全不重要！为什么我女儿出现在他的悬赏令里啊！ 避雷点1简介里，男主是带系统穿越者，知晓剧情，刚穿越那会儿针对性刷过主要角色（老一辈）的好感度，基本上海贼里老一辈的人都对他又爱又恨（无关爱情），未来剧情中会写一些回忆。2男主相当于某点已经功成名就的开挂男主，出场即满级（没人打得过），主要能力是黑色火焰，进而衍生其它能力。3是龙傲天男主功成名就环游世界的日常文，会养孩子，因为很有意思（主要是看过新剧场版，我实在太爱乌塔了，也爱asl）4男主无爱情线，有自己的船员（也就是说会有原创角色）5有的人会救，有的人不会救。6格雷会改变很多东西，他不只是会救人，他喜欢搞事也不甘于人下。原著剧情会改动很多很多，未来他甚至会和四皇都打一架，打赢了当唯一的海上皇帝。艾斯也可能会直接上黑炎的船，不会上白胡子的船，也不认白胡子当老爹。格雷是个很正统的，要干一番大事业的穿越者，而不是随波逐流，踩着剧情的节点把人救下来就行的工具人。他不在乎会不会让剧情脱离掌控，也不介意去抢别人的人。7暂时没想好，要是写到碰雷点，会补充。文案创建时间20221211四皇红发的女儿认我当爹很合理吧四皇红发的女儿认我当爹很合理吧柚目有兮魔蝎小说...
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